MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Bacteroides salanitronis DSM 18170 plasmid pBACSA03

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015166	T	6	6	19	24	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015166	CTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_015166	GAA	2	6	46	51	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015166	CTT	2	6	133	138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
5	NC_015166	TTC	2	6	156	161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
6	NC_015166	TGT	2	6	166	171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959702
7	NC_015166	T	6	6	171	176	0 %	100 %	0 %	0 %	324959702
8	NC_015166	TGT	2	6	226	231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959702
9	NC_015166	TTC	2	6	237	242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
10	NC_015166	TCT	2	6	296	301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
11	NC_015166	TTTC	2	8	350	357	0 %	75 %	0 %	25 %	324959702
12	NC_015166	TTC	2	6	367	372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
13	NC_015166	A	6	6	454	459	100 %	0 %	0 %	0 %	324959702
14	NC_015166	TCTGT	2	10	460	469	0 %	60 %	20 %	20 %	324959702
15	NC_015166	TTC	3	9	496	504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
16	NC_015166	TGGT	2	8	511	518	0 %	50 %	50 %	0 %	324959702
17	NC_015166	GAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959702
18	NC_015166	TGC	2	6	676	681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324959702
19	NC_015166	CAT	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959702
20	NC_015166	TTG	3	9	817	825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959702
21	NC_015166	TTC	2	6	901	906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959702
22	NC_015166	TCCTT	2	10	1015	1024	0 %	60 %	0 %	40 %	324959703
23	NC_015166	CTT	2	6	1028	1033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
24	NC_015166	AGC	2	6	1056	1061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959703
25	NC_015166	AGGA	2	8	1083	1090	50 %	0 %	50 %	0 %	324959703
26	NC_015166	ATA	2	6	1149	1154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324959703
27	NC_015166	TTC	2	6	1161	1166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
28	NC_015166	CTGCC	2	10	1201	1210	0 %	20 %	20 %	60 %	324959703
29	NC_015166	GTT	2	6	1223	1228	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959703
30	NC_015166	TTG	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959703
31	NC_015166	TTC	2	6	1292	1297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
32	NC_015166	TG	3	6	1329	1334	0 %	50 %	50 %	0 %	324959703
33	NC_015166	TTC	2	6	1386	1391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959703
34	NC_015166	AGT	2	6	1486	1491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959703
35	NC_015166	AC	3	6	1522	1527	50 %	0 %	0 %	50 %	324959703
36	NC_015166	AGT	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959703
37	NC_015166	CTACCG	2	12	1573	1584	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	324959703
38	NC_015166	TTA	2	6	1620	1625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015166	ACTA	2	8	1640	1647	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_015166	TATT	2	8	1667	1674	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015166	A	6	6	1749	1754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015166	GA	3	6	1828	1833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015166	CA	3	6	1846	1851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_015166	ACA	2	6	1885	1890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_015166	CAA	2	6	1899	1904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_015166	A	6	6	1937	1942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015166	TCGG	2	8	1947	1954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015166	CGA	2	6	1991	1996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015166	AT	3	6	2015	2020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015166	GTC	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324959704
51	NC_015166	TTC	2	6	2176	2181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959704
52	NC_015166	TCA	2	6	2266	2271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959704
53	NC_015166	AGC	2	6	2272	2277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959704
54	NC_015166	TCA	2	6	2315	2320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959704
55	NC_015166	CTT	2	6	2339	2344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015166	ATC	2	6	2395	2400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959705
57	NC_015166	TTCCG	2	10	2433	2442	0 %	40 %	20 %	40 %	324959705
58	NC_015166	CT	3	6	2457	2462	0 %	50 %	0 %	50 %	324959705
59	NC_015166	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959705
60	NC_015166	CA	3	6	2511	2516	50 %	0 %	0 %	50 %	324959705
61	NC_015166	ATA	2	6	2519	2524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324959705
62	NC_015166	TCT	2	6	2583	2588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959705
63	NC_015166	TGT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959705
64	NC_015166	AT	3	6	2633	2638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015166	CG	3	6	2707	2712	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_015166	CGCTG	2	10	2734	2743	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_015166	TGCTT	2	10	2749	2758	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015166	A	6	6	2873	2878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015166	ATC	2	6	2913	2918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015166	AGC	2	6	2919	2924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_015166	CA	3	6	3008	3013	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015166	TAT	2	6	3113	3118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959706
73	NC_015166	ACT	2	6	3120	3125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959706
74	NC_015166	AGA	2	6	3226	3231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
75	NC_015166	GCCT	2	8	3276	3283	0 %	25 %	25 %	50 %	324959706
76	NC_015166	GAC	2	6	3297	3302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959706
77	NC_015166	AAG	2	6	3322	3327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
78	NC_015166	GAT	2	6	3366	3371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959706
79	NC_015166	GCCTT	2	10	3399	3408	0 %	40 %	20 %	40 %	324959706
80	NC_015166	TTC	2	6	3422	3427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959706
81	NC_015166	TAT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959706
82	NC_015166	AGC	2	6	3509	3514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959706
83	NC_015166	GTT	2	6	3554	3559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959706
84	NC_015166	CTC	2	6	3574	3579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	324959706
85	NC_015166	TGT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	324959706
86	NC_015166	TGC	2	6	3668	3673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	324959706
87	NC_015166	A	7	7	3674	3680	100 %	0 %	0 %	0 %	324959706
88	NC_015166	TGA	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959706
89	NC_015166	AC	3	6	3715	3720	50 %	0 %	0 %	50 %	324959706
90	NC_015166	AAG	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
91	NC_015166	AGA	2	6	3991	3996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959706
92	NC_015166	TA	3	6	4008	4013	50 %	50 %	0 %	0 %	324959706
93	NC_015166	AGAA	2	8	4044	4051	75 %	0 %	25 %	0 %	324959706
94	NC_015166	CA	3	6	4065	4070	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_015166	A	7	7	4074	4080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015166	AAG	2	6	4092	4097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959707
97	NC_015166	A	7	7	4272	4278	100 %	0 %	0 %	0 %	324959707
98	NC_015166	AT	3	6	4294	4299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015166	AAG	2	6	4340	4345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015166	AAGC	2	8	4431	4438	50 %	0 %	25 %	25 %	324959708
101	NC_015166	TC	3	6	4531	4536	0 %	50 %	0 %	50 %	324959708
102	NC_015166	ATC	2	6	4609	4614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959708
103	NC_015166	TGAA	2	8	4622	4629	50 %	25 %	25 %	0 %	324959708
104	NC_015166	ACT	2	6	4680	4685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959708
105	NC_015166	AAC	2	6	4819	4824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	324959708
106	NC_015166	TTC	2	6	4847	4852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959708
107	NC_015166	TGA	2	6	4896	4901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	324959708
108	NC_015166	TTC	2	6	4992	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_015166	AG	3	6	5020	5025	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015166	TAA	2	6	5036	5041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015166	GAGT	2	8	5077	5084	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015166	TAA	2	6	5089	5094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015166	A	6	6	5110	5115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015166	A	6	6	5154	5159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015166	GAG	2	6	5160	5165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015166	TCCTC	2	10	5177	5186	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
117	NC_015166	T	6	6	5187	5192	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015166	TTC	2	6	5249	5254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
119	NC_015166	TTA	2	6	5296	5301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959709
120	NC_015166	AAG	2	6	5356	5361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	324959709
121	NC_015166	TCA	2	6	5368	5373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959709
122	NC_015166	ATT	2	6	5386	5391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	324959709
123	NC_015166	GCA	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	324959709
124	NC_015166	T	6	6	5553	5558	0 %	100 %	0 %	0 %	324959709
125	NC_015166	CTT	2	6	5560	5565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
126	NC_015166	TTC	2	6	5578	5583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
127	NC_015166	TCT	2	6	5605	5610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
128	NC_015166	CTT	2	6	5630	5635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
129	NC_015166	CTGTT	2	10	5653	5662	0 %	60 %	20 %	20 %	324959709
130	NC_015166	TAC	2	6	5681	5686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	324959709
131	NC_015166	TTC	2	6	5711	5716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
132	NC_015166	CATC	2	8	5812	5819	25 %	25 %	0 %	50 %	324959709
133	NC_015166	CAC	2	6	5828	5833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	324959709
134	NC_015166	TGTT	2	8	5847	5854	0 %	75 %	25 %	0 %	324959709
135	NC_015166	TAA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	324959709
136	NC_015166	T	6	6	6036	6041	0 %	100 %	0 %	0 %	324959709
137	NC_015166	CTT	2	6	6053	6058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	324959709
138	NC_015166	AAAG	2	8	6165	6172	75 %	0 %	25 %	0 %	324959709
139	NC_015166	AACAT	2	10	6173	6182	60 %	20 %	0 %	20 %	324959709
140	NC_015166	AATAA	2	10	6188	6197	80 %	20 %	0 %	0 %	324959709
141	NC_015166	AAC	2	6	6225	6230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.